土壤理化性状恶化，有机菌肥无法发挥效果。菌肥中的菌赖以生计的条件是有机质。而80%以上的果园都在施用无机化肥使土壤板结透气性差。使得一些厌气菌很多繁衍，如镰刀菌、整齐小核菌导致的苹果、桃等果树圆斑根腐病、白绢病（茎基腐病）。更严峻的是有机肥极度缺少，破坏了土壤的团粒结构，降低了土壤的保肥保水才能。果农施产品有机菌肥通常都在1.5—4公斤/株，有机质很快被分化使用，果树苗木，有机肥中的菌种失掉赖以生计的条件不能繁衍生计，果树苗批发，大多数逝世。这就是果农在施用产品有机菌肥中发现的地厚施有机菌肥有效果而地薄无效果的道理。
及时浇水。苗木速生期浇水要采取多量少次的方法。每次灌溉要灌透、灌匀，防止冲刷幼苗，伤害苗茎、苗根。每次追肥均应随即浇水，果树苗价格，若天降雨，墒情较好，则不要浇水。在苗木生长后期，应适当控制浇水(除特别干旱外，宿州果树苗，一般不需灌溉)。若苗木冬前不出圃，一定要浇好越冬水。
排水防涝。秋季雨水较多，一旦苗木受涝，对苗木适时出圃影响很大。因此，对苗圃排水设施要及时进行检查，要挖好排水沟，及早发现并排除圃地积水。对雨水侵蚀所破坏的地段、地块要求及时修补，确保圃地土地平整、排水畅通。
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