河道生态治理还需要对河道的污染源、水质、水生态、底泥、陆域植物群落、水工构筑物调度运行等资料进行收集，必要时还需对水质，合肥水体治理，水生态、底泥等开展补充监测和调查。目前，大部分河道生态治理时很少对河道本底进行全面调查，至多收集水质方面的资料，对其余资料收集较少，或者收集不到相关的资料，而补充调查费用较高，建设方不愿意承担。
城市河道不仅要发挥防洪、排涝、蓄水、航行等基本功能， 还需要具有生态、景观、休闲、旅游等功能。因此， 搞好城市河道整治、实现水生态景观目标， 必然要妥善处理好以下几个关系。
1 截污治污与河道整治的关系
要整治城市河道， 恢复河道的自然生态， 恢复其生物的多样性， 首要的任务是截污、治污。截污、治污要从源头抓起， 从长远来看， 要通过政治、经济、法律、行政等手段多管齐下， 实施长效管理; 要通过制定水资源保护规划， 划分水功能区域， 确定纳污总量，水体治理材料， 进行排污总量控制; 要通过创建节水型城市， 倡导节约用水，减少污水产出量; 要通过技术投入， 加大污水处理回用力度， 提高污水利用率， 改善城市水环境
2 水质水量与河道整治的关系
据统计， 在我国现有668座城市中， 有2 /3面临缺水， 城市河道近70%受到不同程度的污染。由于城市地域狭小， 自产水量少， 排污量大， 水质影响严重。因此， 在城市河道整治中， 宜采取多种形式沟通水系， 调活水体。松原市为改善城市水环境，按照“以动制静、以清释污”的要求，建设中的哈达山水利枢纽工程，是以工农业和生活供水为主，兼顾生态环境保护、发电等综合利用，并为以后向辽河流域缺水地区供水创造条件。
3 河流湿地与河道整治的关系
湿地被誉为“地球之肾”。但随着城市人口、工商业、建筑群的高度集中， 相应带来了用地紧张、环境恶化问题。大量的交通路网、公用设施、地块改造使部分河道被蚕食、填堵， 加上生活污水、工业废水进入河道， 造成城市河道水质下降、水功能萎缩， 原有的湿地生态也被破坏。因此，蓝藻水体治理， 为了实现经济社会的可持续发展， 必须在推进城市化进程中， 充分重视保护和恢复城市河流的湿地系统。特别要在河道整治中， 通过规划， 确定科学、合理的水面率，为城市河流内水生物的生息、水生态的恢复创造条件。
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